|
|
Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados. |
Data corrente: |
25/11/2021 |
Data da última atualização: |
29/11/2021 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
BRUNES, L. C.; BALDI, F.; LOPES, F. B.; LOBO, R. B.; ESPIGOLAN, R.; COSTA, M. F. O. e; STAFUZZA, N. B.; MAGNABOSCO, C. de U. |
Afiliação: |
LUDMILLA C. BRUNES; FERNANDO BALDI; FERNANDO B. LOPES; RAYSILDO B. LÔBO; RAFAEL ESPIGOLAN; MARCOS FERNANDO OLIVEIRA E COSTA, CNPAF; NEDENIA B. STAFUZZA; CLAUDIO DE ULHOA MAGNABOSCO, CPAC. |
Título: |
Weighted single-step genome-wide association study and pathway analyses for feed efficiency traits in Nellore cattle. |
Ano de publicação: |
2021 |
Fonte/Imprenta: |
Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 138, n. 1, p. 23-44, Jan. 2021. |
ISSN: |
1439-0388 |
DOI: |
https://doi.org/10.1111/jbg.12496 |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Abstract The aim was to conduct a weighted single-step genome-wide association study to detect genomic regions and putative candidate genes related to residual feed intake, dry matter intake, feed efficiency (FE), feed conversion ratio, residual body weight gain, residual intake and weight gain in Nellore cattle. Several protein-coding genes were identified within the genomic regions that explain more than 0.5% of the ad- ditive genetic variance for these traits. These genes were associated with insulin, leptin, glucose, protein and lipid metabolisms; energy balance; heat and oxidative stress; bile secretion; satiety; feed behaviour; salivation; digestion; and nutrient ab- sorption. Enrichment analysis revealed functional pathways (p-value<.05) such as neuropeptide signalling (GO:0007218), negative regulation of canonical Wingless/ Int-1 (Wnt) signalling (GO:0090090), bitter taste receptor activity (GO:0033038), neuropeptide hormone activity (GO:0005184), bile secretion (bta04976), taste trans- duction (bta0742) and glucagon signalling pathway (bta04922). The identification of these genes, pathways and their respective functions should contribute to a better understanding of the genetic and physiological mechanisms regulating Nellore FE- related traits. |
Palavras-Chave: |
Etapa única ponderada; Ração residual. |
Thesagro: |
Gado; Gado Nelore; Ganho de Peso. |
Thesaurus Nal: |
Body weight; Cattle; Feed intake; Nellore. |
Categoria do assunto: |
-- L Ciência Animal e Produtos de Origem Animal |
URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/228117/1/Marcos-Fernando-Weighted-single-step-genome-wiede-association.pdf
|
Marc: |
LEADER 02281naa a2200337 a 4500 001 2136743 005 2021-11-29 008 2021 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1439-0388 024 7 $ahttps://doi.org/10.1111/jbg.12496$2DOI 100 1 $aBRUNES, L. C. 245 $aWeighted single-step genome-wide association study and pathway analyses for feed efficiency traits in Nellore cattle.$h[electronic resource] 260 $c2021 520 $aAbstract The aim was to conduct a weighted single-step genome-wide association study to detect genomic regions and putative candidate genes related to residual feed intake, dry matter intake, feed efficiency (FE), feed conversion ratio, residual body weight gain, residual intake and weight gain in Nellore cattle. Several protein-coding genes were identified within the genomic regions that explain more than 0.5% of the ad- ditive genetic variance for these traits. These genes were associated with insulin, leptin, glucose, protein and lipid metabolisms; energy balance; heat and oxidative stress; bile secretion; satiety; feed behaviour; salivation; digestion; and nutrient ab- sorption. Enrichment analysis revealed functional pathways (p-value<.05) such as neuropeptide signalling (GO:0007218), negative regulation of canonical Wingless/ Int-1 (Wnt) signalling (GO:0090090), bitter taste receptor activity (GO:0033038), neuropeptide hormone activity (GO:0005184), bile secretion (bta04976), taste trans- duction (bta0742) and glucagon signalling pathway (bta04922). The identification of these genes, pathways and their respective functions should contribute to a better understanding of the genetic and physiological mechanisms regulating Nellore FE- related traits. 650 $aBody weight 650 $aCattle 650 $aFeed intake 650 $aNellore 650 $aGado 650 $aGado Nelore 650 $aGanho de Peso 653 $aEtapa única ponderada 653 $aRação residual 700 1 $aBALDI, F. 700 1 $aLOPES, F. B. 700 1 $aLOBO, R. B. 700 1 $aESPIGOLAN, R. 700 1 $aCOSTA, M. F. O. e 700 1 $aSTAFUZZA, N. B. 700 1 $aMAGNABOSCO, C. de U. 773 $tJournal of Animal Breeding and Genetics$gv. 138, n. 1, p. 23-44, Jan. 2021.
Download
Esconder MarcMostrar Marc Completo |
Registro original: |
Embrapa Arroz e Feijão (CNPAF) |
|
Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
|
|
Registros recuperados : 34 | |
1. | | STAFUZZA, N. B.; CAETANO, A. R.; AMARAL, M. E. J. Mapeamento RH dos genes APOM, BDA20 e CRABP2 no genoma bovino. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 51., 2005, Águas de Lindóia, SP. A era da genômica: da bioestatística à bioinformática: anais. Ribeirão Preto, SP: Sociedade Brasileira de Genética, 2005. p. 194.Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
4. | | VENTURINI, G. C.; STAFUZZA, N. B.; CARDOSO, D. F.; BALDI, F.; LEDUR, M. C.; DANTAS, J. de O.; EL FARO, L.; MUNARI, D. P. Association between ACTA1 candidate gene and performance, organs and carcass traits in broilers. Poultry Science, 16 out. 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
5. | | GRUPIONI, N. V.; STAFUZZA, N. B.; CARVAJAL, A. B.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Association of RUNX2 and TNFSF11 genes with production traits in a paternal broiler line. Genetics and Molecular Research, v. 16, n.1, 2017.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
6. | | PERIPOLLI, E.; STAFUZZA, N. B.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; EGITO, A. A. do; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B. Assessment of copy number variants in three Brazilian locally adapted cattle breeds using whole-genome re-sequencing data. Animal Genetics, v. 54, n. 3, p. 254-270, 2023.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
7. | | FREITAS, L. A. de; GRUPIONI, N. V.; SAVEGNAGO, R. P.; STAFUZZA, N. B.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; SCHMIDT, G. S.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Non-hierarchical cluster analysis for body weight, age at first egg, egg production and egg weight in a laying hen strain. In: INTERNATIONAL MEETING OF ADVANCES IN ANIMAL SCIENCE, 2016, Jaboticabal. Posters presentations... Jabotical: PPGZ Unesp, 2016.Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
8. | | RODRIGUES FILHO, E. A.; STAFUZZA, N. B.; CAETANO, A. R.; GILL, C. A.; RIGGS, P. K.; WOMACK, J. E.; AMARAL, M. E. J. Mapping MHC genes in River Buffalo. In: PINARD, M. H.; GAY, C.; PASTORET, P. P.; DODET, B. (Ed.). Animal genomics for animal health. Basel: Karger, 2008. p. 343-346. (Developments in biologicals, v. 132)Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
Biblioteca(s): Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. |
| |
9. | | BRUNES, L. C.; BALDI, F.; LOPES, F. B.; LOBO, R. B.; ESPIGOLAN, R.; COSTA, M. F. O. e; STAFUZZA, N. B.; MAGNABOSCO, C. de U. Weighted single-step genome-wide association study and pathway analyses for feed efficiency traits in Nellore cattle. Journal of Animal Breeding and Genetics, v. 138, n. 1, p. 23-44, Jan. 2021.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão; Embrapa Cerrados. |
| |
10. | | CRUZ, V. A. R. da; SCHENKEL, F. S.; SAVEGNAGO, R. P.; GRUPIONI, N. V.; STAFUZZA, N. B.; SARGOZAEL, M.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Association of apolipoprotein B and adiponectin receptor 1 genes with carcass, bone integrity and performance traits in a paternal broiler Line. Plos One, v. 10, n.8, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
11. | | PERIPOLLI, E.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; LIMA, A. L. F.; IRGANG, R.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B. Assessment of runs of homozygosity islands and estimates of genomic inbreeding in Gyr (Bos indicus) dairy cattle. BMC Genomics, v. 19, n. 34, 2018. 13 p.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
12. | | FREITAS, L. A. de; SAVEGNAGO, R. P.; GRUPIONI, N. V.; RAMOS, S. B.; STAFUZZA, N. B.; FIGUEIREDO, E. A. P. de; SCHMIDT, G. S.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Reduced-rank estimation of genetic parameters for egg production traits and cluster analyses with predicted breeding values. Acta Agriculturae Scandinavica, Section A ? Animal Science, v. 68, n. 2, p. 81-86, 2019Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
13. | | SBARDELLA, A. P; FONSECA, I.; WELLER, M. A. DEL C. A.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, J. R.; WATANABE, R. N.; COSTA, R, M. da; CARVAJAL, A. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MUNARI, D. P. Avaliação de abordagens estatísticas para análise da expressão gênica diferencial em dados reais de RNA-seq In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
14. | | SBARDELLA, A. P.; FONSECA, I.; WELLER, M. M. D. C. A.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, J. R.; WATANABE, R. N.; COSTA, R. M. da; CARVAJAL, A. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MUNARI, D. P. Avaliação de abordagens estatísticas para análise da expressão gênica diferencial em dados reais de RNA-Seq. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
15. | | GRUPIONI, N. V.; CRUZ, V. A. R. da; STAFUZZA, N. B.; FREITAS, L. A.; RAMOS, S. B.; SAVEGNAGO, R. P.; PEIXOTO, J. de O.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Phenotypic, genetic and environmental parameters for traits related to femur bone integrity and body weight at 42 days of age in a broiler population. Poultry Science, Sep. 15 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
16. | | PERIPOLLI, E.; CHIAIA, H. L. J.; BERTON, M. P.; KLUSKA, S.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; VENTURA, R. V.; BALDI, F.; SILVA, M. V. G. B. Ilhas de homozigose para identificação de genes relacionados com características de importância econômica na pecuária leiteira em bovinos da raça Gir (Bos primigenius indicus) In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 12., 2017, Ribeirão Preto. Anais... Ribeirão Preto: SBMA, 2017. 3 p.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
17. | | STAFUZZA, N. B.; SILVA, R. M. de O.; PERIPOLLI, E.; BEZERRA, L. A. F.; LOBO, R. B.; MAGNABOSCO, C. de U.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; MUNARI, D. P.; LOURENCO, D. A. L.; BALDI, F. Genome-wide association study provides insights into genes related with horn development in Nelore beef cattle. PLoS ONE, v. 13, n. 8, e0202978, August 30, 2018.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Cerrados. |
| |
18. | | VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland. Proceedings... [S.l.: s.n.], 2018.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Gado de Leite. |
| |
19. | | VERARDO, L. L.; STAFUZZA, N. B.; MUNARI, D. P.; ZERLOTINI NETO, A.; CHUD, T. C. S.; GARRICK, D. J.; COLE, J. B.; PANETTO, J. C. do C.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; SILVA, M. V. G. B. A gene-transcription factor network associated with residual feed intake based on SNVs/InDels identified in Gir, Girolando and Holstein cattle breeds. In: WORLD CONGRESS ON GENETICS APPLIED TO LIVESTOCK PRODUCTION, 11., 2018, Auckland. Proceedings... [S.l.: s.n.], 2018. 6 p. Na publicação: A. Zerlotini, J. C. C. Panetto. WCGALP 2018.Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
Biblioteca(s): Embrapa Agricultura Digital. |
| |
20. | | RAGOGNETTI, B. do N. N; STAFUZZA, N. B.; SILVA, T. B. R. da; CHUD, T. C. S.; GRUPIONI, V. A. R.; CRUZ, V. A. R.; DANTAS, J. de O.; NONES, K.; LEDUR, M. C.; MUNARI, D. P. Genetic parameters and mapping quantitative trait loci associated with tibia traits in broilers. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 4, p. 17544-17554, 2015.Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
Biblioteca(s): Embrapa Suínos e Aves. |
| |
Registros recuperados : 34 | |
|
Nenhum registro encontrado para a expressão de busca informada. |
|
|